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細胞係的錯誤鑒定該如何解決

  • 發布日期:2019-03-12      瀏覽次數:1379
    •   細胞係對於生物醫學研究是非常有價值的工具。然而,它們作為正常或患病組織模型的有效性有賴於它們真的是研究人員所認為的組織類型和物種。不幸的是,據估計常用的細胞係中有14%~16%是被錯誤鑒別的。
        錯誤鑒別通常源於交叉汙染(一種培養物被在同一實驗室中培養的另一種細胞係接替),也可能源於細胞培養中的錯誤操作。*,迄今為止建立的個人類癌細胞係HeLa細胞具有頑強的生命力,它們甚至可以存活在氣溶膠液滴中並以此方式汙染其它細胞。由於HeLa細胞生長得特別快,它們終會在數量上超過其它細胞。研究發現被錯誤鑒別的細胞係中有30%~50%是HeLa衍生物[2,3]。對於大多數錯誤鑒別的細胞係來說,再也找不到真實的儲備了。
        盡管從20世紀60年代以來人們已經意識到了細胞係錯誤鑒別的問題,但這個問題仍然普遍存在。例如,在1968年HEp-2被證明是HeLa(宮頸癌細胞)衍生物,但每年仍有研究人員將其作為喉癌細胞係研究並發表論文[1]。在很長一段時間裏,期刊和資助機構都沒有適當的政策要求科學家們對他們使用的細胞係進行鑒定。在過去的十年中情況有所轉變,現在越來越多期刊要求或鼓勵作者進行細胞係的鑒定[1,4],包括BioMedCentral的期刊、《International Journalof Cancer》、Nature出版集團的期刊等等。由於這類期刊數量不斷增加且不同期刊之間要求各異,因此在提交論文前檢查特定期刊的指南非常重要。例如,除了細胞係鑒定的基本要求外,《Journal of Hepatology》還聲明它將不再考慮使用一些已知被錯誤鑒別的細胞係(BEL7402、SMMC7721、MHCC97L等等)。美國國立衛生研究院是將細胞係鑒定作為資助條件的資助機構之一。
        短串聯重複序列(shorttandem repeat)(STR)分析法是期刊接受的人類細胞係鑒定方法,這是一種用於法醫學的DNA指紋技術。它是一種基於PCR的技術,該方法同時測試大量多態微衛星位點。STR分析可以將細胞係匹配到供體(如果供體的STR圖譜是已知的話)或已知STR圖譜的細胞係。然而,如果特意從同一供體上建立了兩種以上細胞係,那麽這兩種細胞係不能通過STR分析來區分。由於細胞傳代的遺傳漂變,所培養的細胞的STR圖譜可能不會與供體100%匹配。目前的標準是用≥80%的匹配來確認細胞係的身份[5]。
        有關這一問題以及使用細胞係的推薦做法的更多信息,請查看細胞係認證委員會(ICLAC)的網站。ICLAC提供當前已知被錯誤鑒別的細胞係的索引,該索引現在列有488種細胞係。你還可以找到人類細胞係STR圖譜數據庫的鏈接以及關於此問題的許多其它的出版物和網址。