:細胞克隆中,對培養(yang) 的細胞來說,從(cong) 原有的克隆中,再篩選出具有某種特性的細胞進行培養(yang) ,就是subclone,分為(wei) 細胞克隆和分子克隆。
一、
1、掌握細菌基因組提取的方法和原理。
2、掌握限製性核酸內(nei) 切酶處理基因組及其結果分析。
3、掌握基因片段回收的方法。
二、
細菌基因組的提取:通過堿法或者酶法裂解細菌之後,可以將胞內(nei) 的核酸和蛋白質全釋放出來。DNA溶於(yu) 1mol/L的NaCl中,不溶於(yu) 0.14mol/L的NaCl,而RNA溶於(yu) 0.14mol/L的NaCl不溶於(yu) 1mol/L的NaCl中,通過溶液中鹽濃度的變化可以將DNA和RNA分開。氯仿-異戊醇法除去蛋白,2倍體(ti) 積乙醇將DNA沉澱出來。
限製性核酸內(nei) 切酶隻作用於(yu) 特定的位點,處理基因組後隻會(hui) 得到有限的片斷。通過單酶切或者多酶切後電泳檢驗就可以得到與(yu) 物種本身有關(guan) 的特定的圖譜。
電泳後選定目的基因的條帶,紫外燈下將含有目的基因的凝膠切下,使用凝膠回收試劑盒,將凝膠溶化後,通過吸附柱時,核酸片段就吸附在柱上,洗脫液洗脫後加入2倍體(ti) 積乙醇,核酸沉澱,TE溶解沉澱,核酸片段得到回收。
三、試劑與(yu) 器材
1、試劑 E.coli JM109,牛肉膏,胰蛋白腖,NaCl,微量細菌基因組抽提試劑盒(上海生工),BamH I、Xho1 核酸內(nei) 切酶(Takara),NEB 標準分子量片段(1kb DNA Ladder),凝膠電泳回收試劑盒
2、器材 高速台式冷凍離心機,水平電泳儀(yi) ,漩渦混合儀(yi) ,紫外檢測儀(yi) ,凝膠成像分析係統,微量移液器及吸頭。
四、操作方法
1.使用LB培養(yang) 基活化、培養(yang) 菌體(ti) 。
2.離心收集菌體(ti) ,根據試劑盒說明提取基因組。
3.限製性酶處理基因組。
4.E.coli JM109的基因組經過限製性內(nei) 切酶處理後,使用瓊脂糖凝膠電泳檢測,凝膠成像係統將酶切圖譜采集下來並對其分析。
5.紫外燈下將需要回收的核酸片段切下來,使用凝膠回收試劑盒回收DNA片段。
6.電泳檢測回收的核酸片段。
五、關(guan) 鍵步驟與(yu) 注意事項
1.菌體(ti) 培養(yang) 過程要嚴(yan) 格無菌,染菌後提取得到的基因組會(hui) 成多條帶,酶切的圖譜也會(hui) 比較複雜。
2.基因組提取過程中所使用的器材要嚴(yan) 格滅菌,防止核酸酶降解基因組。
3.基因組提取過程不可以劇烈振蕩,防止DNA斷鏈。
4.在內(nei) 切酶zui適條件下充分處理基因組,得到正確的圖譜。
5.瓊脂糖溶化要充分。
6.切下凝膠時要注意防護紫外線,電泳結束之後盡快將膠條切下來,凝膠條要窄,脫尾部分不回收。