簡要描述:STR檢測服務:短串聯重複序列 (short tandem repeat , STR) ,也稱微衛星 DNA(microsalite DNA) ,由於(yu) 其能提供大量的遺傳(chuan) 標記,因此被認為(wei) 是繼限製性片段長度多態性 (RFLP) 之後的第二代遺傳(chuan) 標記,STR分析已廣泛應用於(yu) 遺傳(chuan) 製圖、連鎖性分析、親(qin) 子鑒定、疾病基因定位和物種多態性研究等諸多領域。高度多態的微衛星還可以用來在人群進行個(ge) 體(ti) 識別。
微衛星(STR)檢測
STR檢測服務STR原理:
短串聯重複序列(short tandem repeat, STR),也稱微衛星 DNA(microsalite DNA) ,是由2 - 6個(ge) 堿基對作為(wei) 核心單位,串聯重複形成的一類DNA序列,由於(yu) 核心單位重複數目在個(ge) 體(ti) 間呈高度變異性並且數量豐(feng) 富,構成了STR基因座的遺傳(chuan) 多態性。它分布於(yu) 人類整個(ge) 基因組,平均每15 kb就存在一個(ge) STR基因座。人類基因組內(nei) 已發現了七千個(ge) 以上的STR位點。它具有分布廣泛,易於(yu) 檢測,信息量大,有高度多態性並遵循孟德爾共顯性遺傳(chuan) 等優(you) 點。是繼限製性片段長度多態性 (RFLP) 之後的第二代遺傳(chuan) 記,目前STR分析已廣泛應用於(yu) 遺傳(chuan) 製圖、連鎖性分析、法醫學鑒定、疾病基因定位、物種多態性和遺傳(chuan) 病的診斷等諸多領域。
STR檢測服務流程:
1. 客戶提供
A.如果提供基因組DNA:至少提供100 ng DNA樣品(針對每個(ge) 多態性位點,需樣品3-5 ul,濃度為(wei) 30 - 50 ng/ul)。
B.如果提供PCR產(chan) 物:產(chan) 物要通過預實驗的電泳檢測,特異性要好。
C.如果需要設計引物,請提供目的片段序列或者微衛星檢測位點,引物設計好後需要客戶確認。
D.除提供樣品類型,DNA濃度和純度值外,還需要注明可能殘留的抑製劑成分。樣品溶解在ddH2O中,如果不是,請注明溶解液成分。
2. 確定STR位點,設計實驗方案,包括熒光標記的選擇,引物的設計、合成和標記,熒光分子量內(nei) 標的選用等。
3. 按照所設計的實驗方案完成熒光PCR,利用瓊脂糖電泳檢測結果;若PCR產(chan) 物特異性不夠,將進行優(you) 化。
4. PCR產(chan) 物通過ABI 3730XL 測序儀(yi) 器進行毛細管電泳檢測,獲得擴增片段大小的數據。
5. 用GeneScan 3.0/GenoTyper 2.0或GeneMapper 3.2等軟件對收集到的數據進行處理分析,將產(chan) 物片段大小、數量多少的信息轉化成直觀準確的波形圖譜,為(wei) 下一步進行關(guan) 聯分析或連鎖分析等遺傳(chuan) 分析提供可靠的數據。
6.發送準確的微衛星(STR)分型結果報告及PCR產(chan) 物。