上海熒光定量PCR檢測的方法:
熒光定量PCR所使用的熒光化學可分為(wei) 兩(liang) 種:熒光探針和熒光染料。而熒光定量 PCR 的方法相應的可分為(wei) 特異類和非特異類兩(liang) 類,特異性檢測方法是在PCR反應中利用標記熒光染料的基因特異寡核苷酸探針來檢測產(chan) 物;而非特異性檢測方法是在在PCR反應體(ti) 係中,加入過量熒光染料,熒光染料特異性地摻入DNA雙鏈後,發射出熒光信號。前者由於(yu) 增加了探針的識別步驟,特異性更高,但後者則簡便易行。
上海熒光定量PCR檢測zui常用的方法是DNA結合染料SYBR GreenⅠ的非特異性方法和Taqman水解探針的特異性方法,在這裏主要介紹這2種方法,其它方法請參考其它熒光定量PCR資料。
1、非特異性SYBR Green I染料法
SYBR Green I是一種結合於(yu) 所有dsDNA雙螺旋小溝區域的具有綠色激發波長的染料(結合示意圖),在遊離狀態下,SYBR Green I發出微弱的熒光,但一旦與(yu) 雙鏈DNA結合後,熒光大大增強(作用機理圖)。因此,SYBR Green I的熒光信號強度與(yu) 雙鏈DNA的數量相關(guan) ,可以根據熒光信號檢測出PCR體(ti) 係存在的雙鏈DNA數量。
2、特異性Taqman水解探針法
Taqman熒光定量技術是以Taqman熒光探針為(wei) 基礎,Taqman熒光探針為(wei) 一寡核苷酸,兩(liang) 端分別標記一個(ge) 熒光發射基團和一個(ge) 熒光淬滅基團。探針完整時,發射基團發射的熒光信號被淬滅基團吸收;
PCR擴增時,Taq酶的5’-3’外切酶活性將探針酶切降解,使熒光發射基團和熒光淬滅基團分離,從(cong) 而熒光監測係統可接收到熒光信號,即每擴增一條DNA鏈,就有一個(ge) 熒光分子形成,實現了熒光信號的累積與(yu) PCR產(chan) 物形成*同步。從(cong) 而實現定量(如下圖)。常用的熒光基團是FAM, TET, VIC, HEX。